根據(jù)《財政部 商務部 稅務總局關于研發(fā)機構采購設備增值稅政策的公告》（2023年第41號，以下簡稱41號公告）規(guī)定，稅務總局制定了《國家稅務總局關于修訂<研發(fā)機構采購國產(chǎn)設備增值稅退稅管理辦法>的公告》（以下稱《公告》）。現(xiàn)解讀如下：

　　一、制發(fā)背景是什么？

　　為鼓勵科學研究和技術發(fā)展，促進科技進步，國家決定延續(xù)實施研發(fā)機構采購國產(chǎn)設備退還增值稅政策（以下簡稱研發(fā)機構退稅政策），財政部、商務部及稅務總局制發(fā)41號公告。確保研發(fā)機構退稅政策落實到位，稅務總局配套制發(fā)了《公告》，擬就相關征管事宜予以明確，以便征納雙方遵照執(zhí)行。

　　二、具體適用范圍是什么？

　　《公告》明確，適用41號公告的研發(fā)機構采購國產(chǎn)設備退稅業(yè)務，按照本《公告》申報辦理退稅。

　　三、研發(fā)機構如何辦理采購國產(chǎn)設備退稅備案？

　　符合41號公告政策適用條件的研發(fā)機構，應于首次申報采購國產(chǎn)設備增值稅退稅時，憑《出口退（免）稅備案表》、研發(fā)機構資質(zhì)證明資料等，申請辦理退稅備案手續(xù)。需要提醒的是，《出口退（免）稅備案表》內(nèi)容填寫要真實、完整，其中，“企業(yè)類型”應選擇“其他單位”，“出口退（免）稅管理類型”應依據(jù)資質(zhì)證明材料填寫“內(nèi)資研發(fā)機構（簡寫：內(nèi)資機構）”或“外資研發(fā)中心（簡寫：外資中心）”。

　　四、研發(fā)機構如何辦理采購國產(chǎn)設備退稅備案的變更和撤回？

　　（一）如何辦理備案變更。已辦理備案的研發(fā)機構，《出口退（免）稅備案表》中內(nèi)容發(fā)生變更的，須自變更之日起30日內(nèi)，持相關資料向主管稅務機關辦理備案變更。

　　（二）如何辦理備案撤回。研發(fā)機構發(fā)生解散、破產(chǎn)、撤銷以及其他依法應終止采購國產(chǎn)設備退稅事項的，應持相關資料向主管稅務機關辦理備案撤回。主管稅務機關應按規(guī)定結(jié)清退稅款后，辦理備案撤回。外資研發(fā)中心在退稅資格復審前，因自身條件發(fā)生變化，已不符合研發(fā)機構的條件，應自條件變化之日起30日內(nèi)辦理退稅備案撤回。

　　五、研發(fā)機構如何進行采購國產(chǎn)設備退稅申報？

　　研發(fā)機構申報采購國產(chǎn)設備退稅時，需提交《購進自用貨物退稅申報表》、采購國產(chǎn)設備合同、增值稅專用發(fā)票等資料。可辦理的退稅額，為增值稅專用發(fā)票上注明的稅額。

　　六、研發(fā)機構辦理退稅的申報期限規(guī)定如何？

　　研發(fā)機構采購國產(chǎn)設備申報期限為采購國產(chǎn)設備之日（以發(fā)票開具日期為準）次月1日起至次年4月30日前的各增值稅納稅申報期。

　　同時，為持續(xù)優(yōu)化營商環(huán)境，更好服務市場主體，避免納稅人因未及時收齊退稅憑證而無法申報辦理退稅，根據(jù)《財政部 稅務總局關于明確國有農(nóng)用地出租等增值稅政策的公告》（2020年第2號）第四條“納稅人出口貨物勞務、發(fā)生跨境應稅行為，未在規(guī)定期限內(nèi)申報出口退（免）稅或者開具《代理出口貨物證明》的，在收齊退（免）稅憑證及相關電子信息后，即可申報辦理出口退（免）稅”的規(guī)定,《研發(fā)機構采購國產(chǎn)設備增值稅退稅管理辦法》明確，若研發(fā)機構未能在規(guī)定的期限內(nèi)申報退稅，待收齊憑證及信息后，仍可繼續(xù)申報辦理退稅。

　　七、稅務機關如何審核辦理退稅？

　　屬于增值稅一般納稅人的研發(fā)機構申報采購國產(chǎn)設備退稅，主管稅務機關經(jīng)審核符合規(guī)定的，應按規(guī)定辦理退稅。

　　研發(fā)機構申報采購國產(chǎn)設備退稅，如果發(fā)現(xiàn)“審核中發(fā)現(xiàn)疑點，經(jīng)核實仍不能排除疑點”“非增值稅一般納稅人申報退稅”等情形，主管稅務機關應采取發(fā)函調(diào)查或其他方式調(diào)查，在確認增值稅專用發(fā)票真實，且發(fā)票所列設備已由上游按規(guī)定申報納稅后，方可辦理退稅。

　　八、已退稅的國產(chǎn)設備轉(zhuǎn)移或移作他用如何處理？

　　已辦理增值稅退稅的國產(chǎn)設備，自增值稅專用發(fā)票開具之日起3年內(nèi)，設備所有權轉(zhuǎn)移或移作他用的，研發(fā)機構須按照規(guī)定向主管稅務機關補繳已退稅款。補繳已退稅款按以下方法計算：

　　應補繳稅款＝增值稅專用發(fā)票上注明的稅額×（設備折余價值÷設備原值）

　　設備折余價值＝增值稅專用發(fā)票上注明的金額-累計已提折舊

　　累計已提折舊按照企業(yè)所得稅法的有關規(guī)定計算。

　　九、如果研發(fā)機構發(fā)生違法違規(guī)，如何處理？

　　研發(fā)機構騙取采購國產(chǎn)設備增值稅退稅的，主管稅務機關應追回已退稅款，并依照稅收征管法的有關規(guī)定處理。研發(fā)機構涉及重大稅收違法失信案件被依法公布信息的，研發(fā)機構將停止享受采購國產(chǎn)設備退稅政策，并應及時辦理退稅備案撤回。

　　十、執(zhí)行期限規(guī)定是什么？

　　修訂后的《研發(fā)機構采購國產(chǎn)設備增值稅退稅管理辦法》自2024年1月1日起施行，具體以增值稅發(fā)票的開具日期為準。